Il laboratorio per lo studio dei materiali archeologici è utilizzato dal Dipartimento di Archeologia dell'Università di Bologna durante le campagne archeologiche estive nel sito della villa di Teoderico e da studenti e studiosi in discipline storico-archeologiche. E' allestito in un'ampia sala al piano terra del museo e possiede la strumentazione per lo studio dei reperti di scavo (lavaggio, disegno, classificazione, interventi restauro).
Il seminterrato del museo (sala del pozzo) viene utilizzato per laboratori indirizzati ai bambini ed agli adulti (laboratorio di decorazione della pietra, laboratorio di ceramica, laboratorio sulle tecniche di scavo archeologico).
L'antica sala capitolare del convento, in cui è conservato l'originario soffitto ligneo a cassettoni, è la sala conferenze del museo.
Lo spazio ha una capinza di 30-40 persone e può ospitare convegni, conferenze, incontri, corsi e seminari. E' utilizzata anche per mostre temporanee delle opere e dei reperti conservati nei depositi del museo e per esposizioni di artisti contemporanei.
Nell'atrio-biglietteria del museo è allestito un piccolo book-shopcon pubblicazioni di carattere storico-archeologico e gadget in vendita
Il chiostro conventuale è uno degli spazi d'eccellenza per l'incontro fra museo e tessuto sociale.
Ospita mostre (direttamente organizzate dal museo o da enti ed associazioni), conferenze, concerti musicali e spettacoli teatrali.
E' utilizzato per manifestazioni religiose e popolari, ad esempio per la tradizionale festa della Madonna dei Miracoli di Pianetto (8 settembre).
Il museo Mambrini è anche ufficio informazioni di Galeata. All'interno si possono reperire depliant e materiali per visitare l'alta valle del Bidente. Gli operatori forniscono informazioni sul territorio, sui monumenti da visitare, sui mezzi di trasporto, sulle strutture ricettive ecc...
La Biblioteca contiene un migliaio di volumi (manoscritti, incunaboli, cinquecentine, edizioni a stampa) collezionati da Mons. Domenico Mambrini.
La biblioteca ha sede nel Palazzo del Podestà a Galeata (Via Zannetti) ed è consultabile su richiesta.